门司港站于1891年开通，在1942年海底关门隧道(Kan-mon Tunnel)开通之前，一直作为通往”九州(Kyushu)岛的门户”的繁华火车站。
目前的车站大楼建于1914年，1988年成为日本第一个被指定为国家“重要文化财“的火车站。
门司港站和东京站是仅有的两个被指定为国家重要文化财的现役车站建筑。
保护和维修工作于2019年完成，恢复了原有建筑的美丽外观。
同时，在曾经是三等车候车室的地方建起了一家复古、气氛很好的星巴克咖啡店，在二楼曾经是贵宾室的地方，38年来首次恢复了一家高级西餐厅—“Mikado食堂”。
